رئیس جمهور اسبق جمهوری اسلامی ایران در جمع مشاوران گفت: ایران به همت مدافعان شجاع و توانا و ملت فهیم و فداکار توانست رویای فروپاشاندن نظام سیاسی، استقلال، تمامیت ارضی و تمدن تاریخی خود را به شکست بکشاند و در موقعیت عزتمندانهای قرار بگیرد که رسیدن به صلحی پایدار به رغم همه دشواریهایش دور از دسترس نیست.
رئیسجمهوری اسلامی ایران در دورههای هفتم و هشتم در پیامی به شهادت سید کمال خرازی رئیس شورای راهبردی روابط خارجی را به فرزندان شهید و صادق خرازی تسلیت گفت.
سیدمحمد خاتمی با انتشار پیامی تصریح کرد: در این موقعیت خطیر بر دست و بازوی رزمندگان و مدافعان عزت و استقلال و تمامیت ارضی که مایه افتخار کشور و احترام آزادگان جهان شده اند، بوسه میزنم و حمایت از آنان را وظیفه دینی و ملی خود و هم میهنان عزیز میدانم.
حجت الاسلام و المسلمین سید محمد خاتمی در پی شهادت دکتر علی لاریجانی، پیام تسلیت صادر کرد.
سیدمحمد خاتمی در پی انتخاب آیت الله مجتبی خامنه ای به عنوان سومین رهبر ایران نوشت؛ آینده کشور باید بر اساس نیازها و ضرورتهای حیاتی امروز بنا شود.
رئیس جمهوری اسلامی ایران در دورههای هفتم و هشتم عنوان کرد: شهادت رهبر معظم انقلاب، آیتالله خامنهای که به دست ناپاک تجاوزگران زورگو رخ داد، جنایتی است بزرگ و حادثهای دردآور برای امروز و آینده ایران و نشانه ای آشکار از سلطهگرایی حاکم بر جهان امروز و خشم و کینی که دشمنان آزادی و استقلال و عزت ایران و اقتدار و یکپارچگی و ایستادن بر پای خود دارند.
رئیسجمهور اسبق ایران، با حضور در منزل مرحوم آیتالله سید مهدی امام جمارانی، ضمن ابراز همدردی، با خانواده ایشان دیدار و گفتوگو کرد.
سیدمحمد خاتمی بر ضرورت تبیین روشن و باورپذیر حوادث پیش آمده و مقصران آنها، بر لزوم توقف دستگیریها و احضارها و احیاناً احکام نامناسب برای اندیشمندان، هنرمندان و سیاستورزان بخشهای مختلف تاکید و اظهار امیدواری کرد که مسائل دانشگاهها با تدبیر و آرامش و به دور از خشونت های سیاسی و امنیتی و اجتماعی حل و فصل شود.
رئیس دفتر رئیس جمهور در دولت هشتم در پی انتشار شایعهای مبنی بر خروج سیدمحمد خاتمی از کشور نوشت: آقای خاتمی نه مریض است و نه برای معالجه انگلیس رفته.